Infrastructures et moyens
Le laboratoire LER/MPL a été créé le 4 janvier 2005 (décision PDG 2004-580) par regroupement des deux entités Environnement et Ressources Conchylicoles.
Ce laboratoire a la particularité d’être bi-localisé entre Nantes et Lorient.
L'implantation nantaise du LER/MPL est située au sein du centre Atlantique Ifremer de Nantes. Ce centre est installé à Nantes depuis 1974. La compétence géographique de cette implantation porte sur la Loire-Atlantique et la Vendée (partie Nord).
L'implantation lorientaise du LER/MPL est au sein de la station de Lorient. L’équipe LER/MPL s'y est installée depuis novembre 2018, après la fermeture de la station de la Trinité/Mer.
Son secteur de compétence est le Morbihan.
Les deux implantations disposent chacune d’infrastructures et d’outils nécessaires à ses activités
Métrologie
Contrôle métrologique et étalonnage des appareils de mesure des laboratoires et des sondes de mesure de terrain.
Paramètres : Température, salinité, oxygène dissous, masse, turbidité.
Lecture de phytoplancton
Observations et comptages de flores phytoplanctoniques au microscope optique.
Site de Lorient
Unité hydrologie
Moyen à la mer :
2 bateaux : Le Mor Braz (mis à l’eau en décembre 2019) et l’Istrec (long 8.30 m, moteur in-board 200 CV)
Site de Nantes
Laboratoire accrédité pour les analyses des Nutriments
N° accréditation 1-2349, portée disponible sur www.cofrac.fr
Le laboratoire d’analyse des nutriments a été créé en 2008 avec le cofinancement de la Région Pays-de-Loire. 
Il est composé de 4 personnes (responsables techniques, analystes et expert scientifique). Y sont analysées les formes inorganiques et organiques dissous pour les quatre nutriments dans l’eau que sont les silicates, les sels d’azote (nitrates + nitrites, ammonium) et de phosphore (phosphates).
Moyen à la mer :
Bajocasse (embarcation de type semi-rigide de 5.65m).